Dział Finansowo – Księgowy odpowiada za prowadzenie gospodarki finansowej PUP oraz planowanie środków budżetowych i funduszy celowych. Ważnym jego zadaniem jest kontrola dyscypliny budżetowej, a także kontrola wydatków z funduszy celowych i innych źródeł. Dział zajmuje się rozliczaniem i ewidencjonowaniem operacji finansowych i budżetowych oraz obsługą kasową funduszy.
W ramach swoich obowiązków realizuje przepisy o ubezpieczeniu społecznym, zdrowotnym i podatkowym. Sporządza sprawozdania finansowe oraz zajmuje się przechowywaniem i ochroną dokumentacji finansowej zgodnie z zasadami rachunkowości. Dodatkowo, Dział terminowo spłaca zobowiązania, ściąga należności i dochodzi roszczeń PUP.